2007年，
ISA疗法
在临床正式使用。
孔令新
说：“我们是病友的医生、朋友，也是他们康复的指导。而病友除了是我们的患者和朋友外，他们还是我们引路人。疾病的攻克跟病友们的引导分不开，疾病的发展不可预测，对于疾病，我们未知的部分比已知的部分更多。这些已知的部分正在慢慢的宣示出来，等待医务工作者去进一步研究。”
2014年，孔令新在给患者治疗时发现：“有的患者的康复很好，开始治疗后没多久就有明显的改善，之后虽然时有症状反复，但很快也会解决，在治疗结束时，他们的症状基本都消除。但是有一部分患者，虽然也严格按医嘱治疗，疗效却不显著。”
孔令新对他们的病情反复研究。
从脉理到症状，从用药的方向到药品配比都研究了个遍。
引起孔令新注意的是一位异地病友，他的病情是
前列腺钙化
，开始治疗后他的症状时好时坏。
孔令新就他的用药剂量进行了非常认真的研究，并且专门和他进行了电话沟通，告诉他不论有什么情况都要反馈回来。
“这位患者真的反馈了，包括腹泻。”孔令新说：“那时我已经发现前列腺疾病跟胃肠道有关，温热下注多发生在胃肠道。只是我没有想到影响那么大。”
这位患者第三次腹泻时，孔令新建议他到门诊复诊把一次脉。
门诊主任很快就把复诊情况反馈给了孔令新：患者胃肠道比较薄弱，平时不腹泻，但吃了生冷食物后就会出现大便不成形，严重的就出现腹泻。
孔令新立刻就告诉这位患者：“认真注意你的排便，有任何问题都要反馈回来。”
这位患者果真事无巨细反馈回来，孔令新就让他尝试已经研发出来的胃肠散。
“新疆患者少有胃肠问题，但南方患者却多有肠湿热问题。我研究了胃肠散本来是要改善南方病友的胃肠问题。在研发时我的目的还是以治疗前列腺疾病为主，所以胃肠散也有消除浅表性炎症的功效。”
这位病友试用胃肠散后，症状改善明显。
他每一步改变都反馈到了孔令新这里，孔令新在新疆已经把胃肠散用于临床，收到反馈后就告诉各地门诊主任，可以把胃肠散用于胃肠道不好的患者的第一个疗程。
结果很快出来，胃肠散不仅对南方患者的胃肠道改善明显，还让不少疗效不明显的患者疗效明显起来。
之后孔令新进一步发现了前列腺疾病与胃肠道的关系。
“胃肠道是人体健康之源。有一个好的胃肠道，人体才能有足够的营养，在治疗的时候才能对药力进行充分的吸收。不健康的胃肠道当然没有好的吸收功能，同时还会让问题加重。前列腺疾病在中医看来就是温热下注。从胃肠道进行改善，对温热下注进行的是最直接的改善，肯定比不改善好。”
从那时开始，
积善堂
的胃肠道问题越问越详细。
孔令新说：“胃肠道问题就是病友引导我发现的问题。地域不同，疾病也会有不同的症状出现。有的时候这种不同非常微小，易于被忽略。而这种不同对于病友的疾病影响很大，对治疗也非常不利。将来病友还引导我发现更多问题，我一定会认真面对仔细研究，争取把这些问题都一一攻克。这些问题攻克完了，这个疾病也就不再是问题了。希望这一天早点到来。”
